食品学院是东北农业大学的两个特色学院之一，是我国首批享有硕士、博士学位授予权的单位，拥有食品科学与工程学科国家一级学科博士点、博士后流动站，建有乳品科学教育部重点实验室、食品科学与工程国家级实验教学示范中心、乳品工程虚拟仿真实验教学中心，国家牛肉加工技术研发分中心等，并以国家乳业工程技术研究中心、国家大豆工程技术研究中心、国家乳品加工技术研发分中心、国家大豆加工技术研发分中心、国家干乳制品加工技术集成科研基地、国家大豆传统制品加工技术集成科研基地作为研发平台，是人才培养、科学研究、成果转化和文化传承的重要基地。尤其乳品科学、大豆科学等领域在国内享有盛誉，居全国领先地位。

学院前身是1958年成立的畜产品加工专业。1982年开始招收硕士研究生，设立全国第一个动物性食品科学硕士点。1986年获博士学位授予权，是我国动物性食品加工领域第一个博士点。1988年成立了食品科学系。1998年成立食品学院。2017年，成功入选国家“双一流”学科群。